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DeepMind又出神器,AI预测基因变异/突变

基因组如何实现“一体化”预测?又出预测6月25日,DeepMind推出DNA模型AlphaGenome,神器它能够预测人类DNA序列中基因变异或突变如何影响调控基因的基因生物过程。

过去十年间,变异科学家们开发了数十种AI模型解读基因组,突变但多数模型仅专注于单一任务——包括预测基因表达水平,又出预测或是神器确定单个基因中的外显子(基因中的编码序列)是如何被剪切并拼接成不同的蛋白质。

AlphaGenome则可处理高达100万碱基对的基因长DNA序列,预测数千种分子特征,变异例如团队观察到T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)患者的突变基因组特定位置突变。模型还能对比突变序列与未突变序列的又出预测预测结果。

预测单个DNA序列时,神器AlphaGenome在24项评估中有22项的基因表现优于最佳外部模型;预测变异调控效应时,它在26项评估中有24项的变异表现与最佳外部模型相当或更优。

也就是突变说,AlphaGenome能帮助科研人员更全面、更精准地查明潜在病因,并解释与某些性状相关的变异影响。

自2010年成立以来,DeepMind不止一次“惊艳”全球。2016年,AlphaGo在围棋比赛中以4∶1击败世界冠军李世石,攻克这场复杂的信息博弈游戏,其策略令外界震撼。

同年,DeepMind成立医疗健康部门DeepMind Health,明确专注于医疗保健领域。

2018年,初代AlphaFold亮相第13届蛋白质结构预测国际竞赛(CASP13)。两年后,AlphaFold为困扰生物医学五十多年的科学挑战——蛋白质序列如何影响其三维结构(即“蛋白质折叠”)——找到了解决方案。

2024年,AlphaFold 3的蛋白质三维结构预测能力全面覆盖生物分子系统。DeepMind创始人戴密斯·哈萨比斯(Demis Hassabis)凭借在“蛋白质结构预测”方面的贡献,获得2024年诺贝尔化学奖。

相比“蛋白质折叠”问题的单一答案,弄清DNA序列影响更为复杂——涉及单个DNA片段发挥多种相互作用。目前,AlphaGenome侧重于对单个基因变异表现的特征描述,无法全面展现基因变异如何导致复杂的性状或疾病,例如发育和环境因素。

DeepMind表示,将通过AlphaGenome API提供AlphaGenome的预览版,供非商业研究使用,从而收集更多反馈,不断改进模型。随着反馈信息的增加,AlphaGenome将推动基因组学和医疗保健发展,也将惠及更多人群。

这会是下一个诺贝尔奖候选项目吗?

数字智能

01 小米发布AI眼镜

6月26日,小米推出首款AI眼镜,内置超级小爱,实现多模态智能交互,搭载1200万像素超透光学镜头用于拍摄,视频方面支持2K 30FPS高清录制,并且拥有第三方App视频通话与直播功能,起售价为1999元。

• 点评:从小米进军手机、汽车的历史节点来看,AI眼镜这个市场的爆发期要来了吗?(曹妍)

02 龙芯中科发布自主可控CPU

6月26日,龙芯中科(688047.SH)发布龙芯3C6000系列服务器CPU处理器,它采用自主设计的指令集龙架构(LoongArch),最高支持128核256线程,于2024年上半年流片成功。

这是中国自主研发、自主可控的

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